全基因组方法确定了在2023年期间在意大利流通的ASFV菌株中的自然大片段删除.
Claudia Torresi1, Roberta Biccheri1, Cesare Cammà2
1National Reference Laboratory (NRL) for Swine Fever, Istituto Zooprofilattico Sperimentale dell' Umbria e delle Marche "Togo Rosati", 06126 Perugia, Italy.
Pathogens (Basel, Switzerland)
|January 25, 2025
概括
意大利的非洲猪瘟病毒 (ASFV) 基因型II菌株显示出独特的基因组删除和转位. 这些自然存在的被删除的ASFV菌株导致严重的疾病,类似于猪中的野生类型病毒.
科学领域:
- 兽医病毒学 兽医病毒学
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 非洲猪瘟 (ASF) 由于ASF病毒 (ASFV) 基因型II的广泛传播,造成了重大的全球兽医和经济威胁.
- 该病毒导致感染动物的高死亡率,影响了全球的猪种群.
研究的目的:
- 描述在意大利在2022-2023年期间收集的ASFV菌株的基因组特征.
- 调查自然删除的ASFV菌株的体内致病性.
主要方法:
- 来自意大利亚历山大和卡拉布里亚的30个ASFV菌株的全基因组测序.
- 基因组删除和转移的分析.
- 在猪体内实验,以评估被删除菌株的疾病进展.
主要成果:
- 完整的基因组测序揭示了意大利ASFV菌株中的大片段删除和转位.
- 在不同的地理集群中确定了特定的删除 (~4340 bp, 2162 bp, 5137 bp) 和3'断绝.
- 两种菌株表现出转位,而体内研究证实,一个被删除的菌株引起了严重的ASF症状,与野生型病毒相似.
结论:
- 这项研究报告了意大利第一个被删除的ASFV菌株的自然发生.
- 鉴定出的基因组变化是独一无二的,并且与以前记录的菌株有所区别.
- 被删除的ASFV菌株保持病原性,突出显示它们对猪健康的持续威胁.


