在IL-4激活组织居民巨细胞中的遗传变异决定了针对LPS的突变特异性协同反应
Mingming Zhao1, Dragana Jankovic1, Verena M Link2
1Type 2 Immunity Section, Laboratory of Parasitic Diseases, National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID), National Institutes of Health (NIH), Bethesda, MD, USA.
Nature communications
|January 25, 2025
概括
主体遗传学会影响组织居民巨细胞 (TRMs) 对刺激的反应. 遗传变异改变了IL-4诱导的表观遗传重编程,导致对脂多糖 (LPS) 暴露的菌株特定协同反应.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 遗传学 遗传学 是一个
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
背景情况:
- 主体遗传背景显著影响组织环境中的巨细胞功能.
- 了解巨细胞如何基于遗传学整合多种刺激至关重要,但人们对此了解甚少.
研究的目的:
- 为了研究来自C57BL/6和BALB/c小鼠的组织寄存巨细胞 (TRMs) 对干白素-4 (IL-4) 刺激的菌株特异性体内反应.
- 探索在遗传上不同的TRMs中对脂聚糖 (LPS) 暴露的表观遗传重编程和协同反应.
主要方法:
- 在体内对C57BL/6和BALB/c小鼠的腹TRM进行IL-4刺激.
- 表观基因组分析,包括增强剂和拓关联域 (TAD) 边界识别.
- 在混合骨髓仿真体上进行体外脂聚糖体 (LPS) 刺激试验和单细胞RNA测序 (scRNA-seq).
主要成果:
- C57BL/6 TRMs对IL-4的转录反应更强,超强增强剂,诱导增强剂和TAD边界的相关增加.
- IL-4刺激诱导了NF-κB,IRF和STAT转录因子动机的C57BL/6特定丰富.
- 用IL-4为原料的C57BL/6TRMs对LPS表现出增强的协同反应,与原始BALB/cTRMs中较高的基底LPS反应形成鲜明对比.
- scRNA-seq证实,转录差异和协同反应是相同组织环境中的细胞内在的.
结论:
- 遗传变异从根本上改变了TRMs中的IL-4诱导的表观遗传重编程.
- 这种重编程会导致对后续刺激 (如LPS) 产生菌株特异的协同反应.
- 这些发现强调了宿主遗传在塑造巨细胞功能可塑性和免疫反应方面的关键作用.
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