通过基于结构的虚拟查和基于酶的检测,确定天然产品是猫科冠状病毒Mpro抑制剂
Zunyun Jiang1, Lianhua Piao2,3, Changyi Ren3
1Jiangsu Key Laboratory of Pesticide Science, College of Sciences, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, P.R. China.
ACS omega
|January 27, 2025
概括
自然化合物被选以抑制猫科冠状病毒Mpro,猫科传染性周周炎的关键目标. 一些化合物,包括theaflavin 3,3-digallate,显示出显著的抑制作用,为新的FIP治疗提供了潜力.
科学领域:
- 兽医病毒学 兽医病毒学
- 药物发现 药物发现 药物发现
- 计算化学计算化学
背景情况:
- 猫型冠状病毒 (FCoV) 引起猫型传染性腹膜炎 (FIP),这是猫的一种致命疾病.
- 病毒主要蛋白酶 (Mpro) 对于FCoV复制至关重要,也是关键的药物标.
研究的目的:
- 确定抑制FCoV Mpro.的强效和低毒性天然化合物.
- 探索这些化合物与Mpro活性部位的结合相互作用.
主要方法:
- 对天然产品库进行针对FCoV Mpro.的虚拟查.
- 酶抑制试验用于确定选定化合物的疗效.
- 模拟分子动力学和结合自由能量计算以分析相互作用.
主要成果:
- 86个化合物最初是根据对接分数进行选择的.
- 十二种化合物在200μmol/L时表现出超过40%的Mpro抑制.
- 甲亚弗拉3,3'-二甲酸盐,赛诺化物C,平诺布林-罗-HHDP-G和宁A的IC50值在25.0~50.6μmol/L之间.
- 类药物和黄类药物也表现出显著的抑制活性.
- 模拟显示了化合物和Mpro活性部位残留物 (His-41,Cys-144,Glu-165) 之间的关键相互作用.
结论:
- 天然产品,特别是theaflavin 3,3'-digallate和sennoside C,是FCoV Mpro.的有效抑制剂.
- 这些已识别的化合物代表了开发新型FIP治疗方法的有希望的线索.
- 详细的结合分析为未来的药物设计和优化提供了洞察力.
