分子诊断技术对急性呼吸道感染哨兵监测计划的影响,安提阿基亚,哥伦比亚,2022年
María Angélica Maya1, Celeny Ortiz2, Francisco Averhoff3,4
1GHI One Health Colombia, Universidad Nacional de Colombia, Medellín, Colombia.
Frontiers in epidemiology
|January 27, 2025
概括
增加多重聚合酶链反应 (mPCR) 在急性呼吸道感染 (ARI) 监测中显著提高了病原体检测. 这种先进的分子方法应该被整合到常规诊断中,以提高公共卫生洞察力.
科学领域:
- 传染性疾病 传染性疾病
- 分子诊断学 分子诊断
- 公共卫生监督 公共卫生监督
背景情况:
- 急性呼吸道感染 (ARI) 监测对于指导公共卫生干预,包括疫苗接种和治疗策略至关重要.
- 像直接免疫光 (DIF) 这样的传统方法是ARI监测的标准,但在病原体检测方面可能存在局限性.
- 多重聚合酶连锁反应 (mPCR) 为识别更广泛的呼吸道病原体提供了更全面的方法.
研究的目的:
- 评估将mPCR纳入常规ARI监测协议的影响.
- 为了比较常规方法和mPCR的添加之间的病原体检测率.
- 评估mPCR对在ARI病例中识别特定病原体的贡献.
主要方法:
- 分析了患有类似流感疾病 (ILI) 和严重急性呼吸道感染 (SARI) 的患者的呼吸道样本.
- 一个使用DIF和SARS-CoV-2 PCR的常规方法最初被应用.
- 采用常规方法呈阴性样本随后使用mPCR进行了测试,剩余的阴性样本进行了测序.
主要成果:
- 使用常规方法检测到43.8%的样本中有病原体.
- mPCR在93.4%的样本中发现了病原体,这些样本在常规测试后呈阴性,使总体检测率提高到96.3%.
- 虽然常规方法最常见的是呼吸道同胞性病毒,但mPCR最常见的是*Haemophilus influenzae*,这凸显了mPCR更广泛的检测能力.
结论:
- 与基于DIF的方法相比,mPCR的整合显著提高了ARI监测中病毒和细菌的检测能力.
- mPCR在病原体识别方面显著改善,调整后的发病率比率为4.22.
- 建议在ARI监测中常规实施mPCR,以提高诊断准确性和公共卫生决策.
