一个全球数据集的淡水鱼的营养互动
Jacob Ridgway1,2, Jeff Wesner3
1University of South Dakota, Department of Biology, Vermillion, SD, 57069, USA. jridgway@utah.gov.
Scientific data
|January 27, 2025
概括
这项研究介绍了TroPhish,这是一个关于淡水鱼类饮食的全面数据库,巩固了超过一个世纪的生态文献. 它增强了现有的资源,如FishBase,提高了鱼类管理和研究的可访问性.
科学领域:
- 生态生态学 生态生态学
- 鱼类学 鱼类学 鱼类学
- 水产资源管理 水产资源管理
背景情况:
- 淡水鱼类的管理严重依赖于热带数据,但获得特定物种的饮食信息是具有挑战性的.
- 像FishBase这样的现有数据库由于其开发时间表和排除了大量的生态文献而存在局限性.
研究的目的:
- 通过将100多年的捕食文献数字化,创建一个统一的,可搜索的淡水鱼类饮食信息数据集.
- 扩展和与FishBase数据库集成,增强其范围和实用性.
主要方法:
- 数字化的饮食数据来自1106篇发表的论文,论文,论文和政府报告,跨越了一个多世纪.
- 使用第三方软件 (Able2Extract) 进行数据扫描,然后与FishBase进行重组和整合.
- 开发了TroPhish项目,以创建一个统一的数据集,包括为4,571个独特样本提供54,750个饮食观察.
主要成果:
- 综合数据集包括9% (982) 的淡水鱼物种和43% (111) 的淡水鱼家族的饮食信息.
- 鱼类物种和家族的地理代表性因大陆而异,物种代表性从3-32%和家族从34-75%不等.
- 统一数据集为了解淡水鱼的食物营养生态提供了显著扩展的资源.
结论:
- "TroPhish"项目成功创建了一个大规模的,统一的淡水鱼的饮食信息数据集,解决了生态研究中的关键差距.
- 这种增强的数据集提高了热带数据的可访问性和全面性,支持更有效的淡水鱼类管理和研究.
- 该项目通过GitHub鼓励社区贡献,促进持续的数据改进和扩展.
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