激活Hhex的常见的小鼠逆转录病毒整合部位标志着在人类早期T细胞前体白血病中被选择的远端调节增强剂
Joyce Hardwick1, Javier Rodriguez-Hernaez2, Giovanni Gambi3
1Division of Hematology/Oncology, Indiana University School of Medicine, Indianapolis, Indiana, USA; Department of Medicine, R.L. Roudebush Indianapolis VA Medical Center, Indianapolis, Indiana, USA.
The Journal of biological chemistry
|January 29, 2025
概括
在Hhex基因附近的逆转录病毒集成通过利用发育性cis调节元件 (CRE) 激活其表达. 这种CRE在早期T细胞急性淋巴细胞白血病 (ETP-ALL) 通过LMO2/LDB1复合体的发病过程中至关重要.
科学领域:
- 血液形成和发育生物学
- 瘤学和癌症研究.
- 基因调节和表观遗传学
背景情况:
- 赫克斯基因对胚胎和产后发育至关重要,特别是在造血组织中.
- 复原病毒整合经常发生在Hhex附近,这表明它在基因调节中的作用.
- 了解这些整合是解读血液形成性恶性瘤机制的关键.
研究的目的:
- 研究复原病毒整合激活Hhex基因表达的机制.
- 为了描述参与Hhex激活的cis调节元件 (CRE).
- 阐明特定转录因子及其复合体在ETP-ALL病变发生中的作用.
主要方法:
- 在AKXD T-ALL小鼠模型中分析逆转录病毒整合部位.
- 在小鼠原生细胞和ChIP外核酶试验中的ATAC-seq.
- 在人类造血细胞系中评估H3K27乙化.
- 虚拟4C分析用于研究DNA循环相互作用.
主要成果:
- 在T-ALL中常见的逆转录病毒整合位于Hhex的57-61kb 3',激活其表达.
- 整合区域表现出特定于发育阶段的CRE特征,具有活跃的表观遗传标记.
- LDB1,LMO2,GATA1和TAL1转录因子与GATA位点和CRE中的复合GATA-E盒结合.
- 一个+65kb的CRE与ETP-ALL和正常原始细胞中的HHEX内突1增强体相互作用.
结论:
- 复原病毒整合可以针对并利用 cis 调节元件 (CREs).
- 在Hhex附近新发现的+65kb CRE在ETP-ALL病变发生过程中被选择.
- 在ETP-ALL的背景下,LMO2/LDB1复合体在HHEX激活中发挥着关键作用.
关键词:
在LDB1中,它是LDB1的.在LMO2中使用LMO2.在这种情况下,染色染色素复杂的复杂的复杂.增强剂是一种增强剂.这种白血病是白血病.一个循环循环的循环.突变发生的突变发生.活动主办人 活动主办人复原病毒复原病毒转录 转录 是一种转录.更多相关视频
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