暴露于化抛的Sphingobium chinhatense IP26的代谢组 - 使用RASER有效的数据分析
Flurin Mathis1, Silvan Iten1, Marco Knobloch2
1Empa, Swiss Federal Laboratories for Materials Testing and Research, Laboratory for Advanced Analytical Technologies, Überlandstrasse 129, CH-8600, Dübendorf, Switzerland; ZHAW, Zurich University of Applied Sciences, Institute of Chemistry and Biotechnology, Einsiedlerstrasse 31, CH-8820, Wädenswil, Switzerland.
这项研究揭示了Sphingobium chinhatense如何将短链甲 (SCCPs) 代谢成各种化化合物和烯酸. 细菌是一种细菌.
科学领域:
- 环境化学环境化学
- 微生物的新陈代谢
- 生物修复是一种生物修复.
背景情况:
- 短链甲 (SCCP) 是复杂的工业化学物质,具有众多的异构体.
- 了解它们的环境命运和退化途径对于风险评估至关重要.
研究的目的:
- 为了研究技术性SCCP混合物的微生物降解,由Sphingobium chinhatense IP26.
- 为了识别和描述这种生物转化过程中产生的代谢物.
主要方法:
- 使用高分辨率质谱 (HRMS) 分析SCCP混合物并识别代谢物.
- 在生物转化实验中使用了表达LinA和LinB酶的Sphingobium chinhatense IP26.
- 自动光谱评估程序 (RASER) 适应了代谢物识别.
主要成果:
- 在技术混合物中确定了33种SCCP同类物,27种烯 (COs) 和18种二烯 (CdiOs).
- 暴露于S. chinhatense导致176种代谢物,包括化CPs (CP-ols,CP-diols,CP-triols,CP-tetraols),CO-ols,CO-diols和CdiO-ols.
- 证实了酶LinA (脱基酶) 和LinB (脱基酶) 在生物转化中是活跃的.
结论:
- 斯芬戈 (Sphingobium chinhatense) 有效地将SCCP转化为一系列多样化的氧化和烯酸代谢产物.
- 这项研究提供了SCCP生物转化的详细代谢概况,有助于在环境样本中检测这些化合物.
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