截断增强的Aptamer绑定亲和度及其作为检测Macrobrachium rosenbergii Nodavirus的传感器的潜力
Norazli Ghadin1, Syarul Nataqain Baharum1, Nurul Hanun Ahmad Raston2
1Institute of Systems Biology, Universiti Kebangsaan Malaysia, Bangi, Selangor, Malaysia.
Journal of fish diseases
|January 31, 2025
概括
截断一个阿普坦酶显著提高了其结合亲和力和检测Macrobrachium rosenbergii nodavirus (MrNV) 的敏感性. 这一进步为在养殖中发现白尾病的快速,经济高效的诊断测试铺平了道路.
科学领域:
- 水生动物卫生 水生动物卫生
- 分子诊断学 分子诊断学
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 由Macrobrachium rosenbergii nodavirus (MrNV) 引起的白尾病导致了养殖中的灾难性死亡率.
- 目前的MrNV检测方法昂贵且缓慢,阻碍了有效的疾病管理.
- 迫切需要快速,负担得起的诊断工具来打击MrNV疫情.
研究的目的:
- 为了研究阿普他默切割对与MrNV体蛋白结合亲和力的影响.
- 提高基于aptamer的MrNV检测的灵敏度和效率.
- 探索为MrNV.开发一种实用的基于aptamer的诊断套件.
主要方法:
- 通过磁性捕获SELEX和下一代测序,与MrNV体蛋白分离和识别一种高亲和度的体.
- 系统的切断的aptamer在初级突起区域.
- 评估结合亲和力,解离常数 (Kd),检测极限 (LOD) 和量化极限 (LOQ) 的截断aptamers.
- 测试开发使用酶连接的aptamer测试和金纳米粒子aptassensor与MrNV感染的样本.
主要成果:
- 在原料突起处的aptamer截断显著增强了结合亲和力,将Kd从347nM降低到30.1nM.
- 截断的阿帕特马体表现出增加的敏感性,LOD从5.64 nM降至1.7 nM,LOQ从17.1 nM降至5.16 nM.
- 测试表明,蛋白度干扰了MrNV检测,需要优化样本准备.
结论:
- 截断的体体表现出对MrNV检测具有卓越的灵敏度和结合亲和力.
- 基于aptamer的传感器,特别是侧流量测定,为在水产养殖中诊断MrNV提供了一个有希望的用户友好和成本效益的解决方案.
- 进一步开发可能会导致一个实用的诊断套件,用于快速地在现场检测MrNV,减轻重大经济损失.
