虚拟组织微阵列用于验证结肠直肠癌中数字生物标志物分析

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 病理学 病理学 病理学
• 生物标志物发现发现

背景情况:

• 组织微阵列 (TMA) 对于高通量生物标志物分析至关重要.
• TMA可能无法捕捉整个组织截面 (WTS) 的全部异质性,这可能导致生物标志物量化不准确.
• 了解TMA的代表性对于可靠的生物标志物验证至关重要.

研究的目的:

• 确定虚拟TMA所需的最小组织核心数量,以实现与WTS相比的生物标志物定量精度.
• 评估核心数和组织区域 (瘤中心与侵入边缘) 对生物标志物表达精度的影响.
• 评估虚拟TMAs对优化TMA构建在结直肠癌中的生物标志物分析的实用性.

主要方法:

• 在50例结直肠癌和36例微卫星不稳定病例中,对免疫细胞和纤维细胞进行免疫组织化学染色.
• 数字化WTS和创建虚拟的TMA与不同的核心数量.
• 分析使用布兰德-阿尔特曼图表来比较虚拟TMA和WTS之间的生物标志物量化.

主要成果:

• 观察到TMA和WTS之间存在很大的分歧,随着核心的增加而减少,但即使有8个核心也仍然显著.
• 特别是具有3-4个核心的TMA倾向于低估瘤中心和特定细胞类型中的生物标志物表达.
• 尽管低估了,但3个核心足以将生物标志物分类为低表达和高表达组.
• 微卫星不稳定的瘤表现出高度的异质性,由BRAF变体加剧.

结论:

• 虚拟TMA对于确定生物标志物分析的最佳核心数量是有效的.
• 根据生物标志物,组织区域和瘤亚型,TMA的代表性有所不同.
• 在大规模临床研究之前,对特定生物标志物的TMA与WTS进行彻底验证是必不可少的.