多倍体QTL-seq识别了QTLs,控制了土豆肉的颜色和粉含量的度依赖于度的方式

科学领域:

• 植物遗传学 植物遗传学
• 基因组学就是基因组学.
• 农作物科学 农作物科学

背景情况:

• 由于复杂的染色体遗传,多化作物在定量特征位点 (QTL) 识别方面存在挑战.
• 以前的基于全基因组测序的多倍体QTL-seq方法主要集中在简单的多态.
• 在多倍体中使用DNA标记器辅助的繁殖需要强大的QTL映射策略.

研究的目的:

• 为了验证检测双重定量特征位点 (QTLs) 在四形土豆 (Solanum tuberosum L.).
• 探索QTLs控制结核肉色和粉含量.
• 通过完善QTL映射,促进多倍体作物中DNA标记器辅助的育种.

主要方法:

• 对基于全基因组测序的多倍体QTL-seq.进行分析设置的修改.
• 使用F1后代来自四形土豆品种"Touya"和"Benimaru"之间的交叉.
• 使用定量PCR,碎片分析和安普利康序列测序,开发可通过度区分的DNA标记物.

主要成果:

• 在染色体3上发现了一种黄肉色的单个QTL,与β-胡卜素氧酶基因相关.
• 在粉合成II基因附近的染色体2上检测到与粉含量降低相关的QTL.
• 对降低粉含量而言,发现了取决于基因基因的剂量影响.

结论:

• 精细的多倍体QTL-seq管道有效地检测到超出简单多态的多功能QTL.
• 这一进步有助于识别控制多倍种作物的重要农学特征的基因.
• 开发的DNA标记物和方法支持多种多体物种的DNA标记物辅助繁殖.