ZFIN更新以支持斑马鱼环境暴露数据
Yvonne M Bradford1, Ceri E Van Slyke1, Jonathan B Muyskens1
1The Institute of Neuroscience, University of Oregon, 5291 University of Oregon, Eugene, OR 97403-5291, USA.
Genetics
|February 4, 2025
概括
斑马鱼信息网络 (ZFIN) 现在通过结合化学暴露数据,更好地支持毒理学研究. 这种增强使研究人员能够更容易地找到和分析斑马鱼中化学链接的表型和疾病模型.
科学领域:
- *发育生物学和毒理学研究.
- *使用斑马鱼 (Danio rerio) 作为模型生物.
背景情况:
- *斑马鱼信息网络 (ZFIN) 是斑马鱼遗传,基因组和表型数据的主要资源.
- *斑马鱼越来越多地用于研究环境暴露,毒性和基因化学相互作用.
- *现有的斑马鱼毒理数据库资源有限.
研究的目的:
- * 增强ZFIN在纳入和呈现毒理学数据方面的功能.
- * 提高斑马鱼化学暴露相关研究的可发现性.
- *详细说明ZFIN如何显示和允许搜索化学暴露实验数据.
主要方法:
- *扩大了ZFIN的数据策划,包括毒理学信息.
- *使用生物兴趣化学实体本体学 (ChEBI) 进行注释的化学物质.
- * 采用斑马鱼实验条件本体 (ZECO) 来确定暴露途径和条件.
- *将实验条件数据集成到基因表达,表型和疾病模型注释中.
主要成果:
- *ZFIN现在可以更好地捕获和显示斑马鱼化学物质暴露数据.
- *化学术语页提供有关化学物质暴露的详细信息.
- * 可提供化学物质暴露数据的增强搜索和下载功能.
- *与化学品相关的表型和人类疾病模型可以更有效地进行搜索.
结论:
- *ZFIN的扩展功能改善了斑马鱼毒理学研究.
- *综合数据有助于更深入地了解基因化学相互作用和环境暴露的影响.
- *研究人员现在可以更有效地利用ZFIN进行斑马鱼的化学暴露研究.


