在无花果树中基于PCR检测Botryosphaeria瘤病原体
Mahdiyeh Ghaedi1, Zeinab Bolboli1, Hamed Negahban1
1Department of Plant Protection, School of Agriculture, Shiraz University, Shiraz, 7144113131, Iran.
Scientific reports
|February 5, 2025
概括
这项研究开发了一种PCR试验,用于检测无花果树中的Botryosphaeriaceae病原体. 与传统培养相比,新的分子方法提高了Neoscytalidium dimidiatum的检测率.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 分子生物学分子生物学
- 农业科学 农业科学
背景情况:
- 植物菌 (Botryosphaeriaceae) 在木质作物中引起癌症和衰退,影响农业和生态系统.
- 由于潜在的感染和多种病原体存在,检测这些病原体是很困难的.
- 无花果树在经济上很重要,容易感染这些疾病.
研究的目的:
- 开发和验证一种聚合酶连锁反应 (PCR) 试验,用于检测三种关键的Botryosphaeriaceae物种.
- 为了比较开发的PCR测定与传统培养方法的疗效,用于在无花果树中检测病原体.
- 评估伊朗法尔斯省无花果树中Botryosphaeriaceae病原体的流行情况.
主要方法:
- 开发出特定物种的原始配对 (TUB-Bd1,TUB-Np1,RPB-Nd2) 针对β-tubulin和RNA聚合酶II基因.
- 利用PCR和嵌套PCR来放大来自纯种植物和受感染无花果组织的目标DNA.
- 从伊朗法尔斯省收集和分析了180个症状和无症状的无花果样本.
主要成果:
- 初始对RPB-Nd2在25.5%的症状和13%的无症状无花果样本中成功检测到Neoscytalidium dimidiatum.
- 对N. dimidiatum的PCR检测率明显高于传统培养方法 (6.67%) 的检测率.
- 在使用嵌套PCR分析的无花果样本中没有检测到Botryosphaeria dothidea和Neofusicoccum parvum.
结论:
- 分子技术,特别是PCR,为检测无花果树中的Botryosphaeriaceae病原体提供了更敏感和更有效的方法.
- 开发的测定有助于早期检测明显和潜在的感染,这对于疾病管理至关重要.
- 多重PCR可以同时检测多个目标Botryosphaeriaceae病原体,简化诊断.
