在平衡选择下的一种反转多态,涉及巨大的移动元素,在一个侵入性真菌病原体中
Fanny E Hartmann1, Ricardo C Rodríguez de la Vega1, Arthur Demené2
1Ecologie Systematique et Evolution, CNRS, Université Paris-Saclay, AgroParisTech, Gif-sur-Yvette F-91190, France.
在栗子菌Cryphonectria parasitica的交配类型位点附近的一个大型非重组基因组区域显示了两个不同的单独类型的平衡选择,可能有助于适应.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 进化生物学 进化生物学
- 菌类学 菌类学是指菌类学.
背景情况:
- 重组抑制可以推动性染色体或超基因的进化.
- 以前有人认为Cryphonectria parasitica中的一个基因组区域是非重组的,并且与交配类型 (MAT) 位点相关.
研究的目的:
- 调查Cryphonectria parasitica中MAT近位区域的重组状态和进化史.
- 描述这一地区内单元类型的遗传构成和多样性.
主要方法:
- 分析了数百个现有的C.寄生虫基因组.
- 产生新的高质量的基因组组件.
- 进行比较基因组分析以确定结构变异和序列分歧.
主要成果:
- 一个接近MAT位点的~1.2 Mb区域在C. parasitica.中缺乏重组.
- 两个高度差异化的单元类型以平衡的比例分离,其中一个显示出被入侵范围的反转.
- 这个区域含有特定的基因,包括可转移的元素 (星际飞船),并显示了非同义替代和基因存在/缺失多态的丰富.
结论:
- 通过平衡C. parasitica. 的选择来维持与MAT位点相关的大型非重组区域.
- 这些单元类型,可能参与了适应,表现出不同的进化历史和遗传特征.
- 这些发现揭示了重要树木病原体的适应机制.
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