头部和部状细胞癌中的微生物特征:一项in silico研究
Loganathan Kavitha1, Manogaran Kuzhalmozhi2, Jayaseelan Vijayashree Priyadharsini3
1The Tamil Nadu Dr. MGR Medical University, Ragas Dental College and Hospital, Department of Oral and Maxillofacial Pathology, Chennai, India.
Journal of applied oral science : revista FOB
|February 5, 2025
概括
口腔和肠道微生物组失调与头部和部状细胞癌 (HNSCC) 有关. 这项研究揭示了HNSCC中独特的细菌概况,这意味着微生物与宿主基因组相互作用在癌症发育中.
科学领域:
- 微生物组研究的研究.
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 口腔和肠道微生物群中的微生物失调与包括癌症在内的各种病理有关.
- 口腔肠道微生物轴的不平衡与头部和部状细胞癌 (HNSCC) 有关.
研究的目的:
- 在不同分类层面分析HNSCC的细菌概况.
- 调查与HNSCC中流行的细菌族相关的分子模式.
- 为了比较HNSCC和胃肠道 (GI) 癌症的细菌概况.
主要方法:
- 利用癌症微生物组图谱 (TCMA) 数据库进行微生物宿主转录组,蛋白组和表观遗传分析.
- 采用UALCAN和CPTAC数据库来分析宿主mRNA转录和与瘤微生物组相关的蛋白质的差异表达.
- 进行了计算分析,以比较HNSCC和肠道癌之间的细菌概况.
主要成果:
- 观察到在HNSCC与正常粘膜中的类水平下降了Actinobacteria和丰富的Flavobacteria.
- 确定了RICTOR蛋白,特定的mRNA转录 (HIST1H2BB,SCARNA11,TBC1D21) 和hsa-miR-200a-5pmiRNA与HNSCC中普遍存在的细菌物种之间的显著相关性.
- 与肠道癌相比,在HNSCC中发现了Actinobacteria,Fusobacteria和Spirochaetes的显着增加.
结论:
- 在HNSCC和肠道癌中细菌物种的不同丰富程度突显了口腔肠道微生物失调症.
- 研究结果表明,瘤微生物组及其与宿主之间的基因组相互作用参与了致癌过程.
