微调GBS数据,比较参考基因组和模拟基因组方法,以推进在较少研究的养殖物种中进行基因组选择

Daniel Fischer1, Miika Tapio2, Oliver Bitz2

  • 1Applied Statistical Methods, Natural Resources, Natural Resources Institute Finland (Luke), Jokioinen, 31600, Finland. daniel.fischer@luke.fi.

BMC genomics
|February 5, 2025
PubMed
概括

这项研究优化了一种具有成本效益的基因型测序 (GBS) 双消化RAD测序 (ddRAD) 管道,用于各种养殖物种. 这种用户友好的工作流程使得即使没有参考基因组,也能有效地进行基因组定型,从而促进非模型生物体的基因组选择.