一个完全自动化的深度测序平台的性能评估,用于乙型肝炎的基因型和耐药性测试
Valérie Ortonne1,2, Magali Bouvier-Alias1,2, Erwan Vo-Quang2,3
1Department of Virology, French National Reference Center for Hepatitis B, C and D Viruses, Hôpital Henri Mondor (AP-HP), Université Paris-Est, Créteil, France.
The Journal of antimicrobial chemotherapy
|February 7, 2025
概括
在ViroKey® SQ FLEX基因型检测准确确定乙型肝炎病毒 (HBV) 基因型和耐药性概况. 这种深度测序方法在检测HBV变异方面比人口测序更为敏感.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 分子诊断学 分子诊断
- 肝病学 肝病学是一种肝病学.
背景情况:
- 慢性乙型肝炎的治疗需要长期的核胺模拟疗法.
- 耐药乙型肝炎病毒 (HBV) 菌株在终身治疗中是一个重大挑战.
- 参考实验室的国际指导方针建议进行乙型肝炎耐药性测试.
研究的目的:
- 评估基于深度测序的ViroKey® SQ FLEX基因型鉴定试验的性能.
- 评估该试验在确定HBV基因型和耐药性概况方面的能力.
主要方法:
- 分析了慢性乙型肝炎患者的血样本.
- 测序使用桑格 (人口) 测序和ViroKey® SQ FLEX基因型测试 (深度测序) 进行了测序.
- 测序了HBV的P/S重叠基因区域.
主要成果:
- ViroKey® SQ FLEX 基因型定型试验证明了与各种HBV基因型的种群测序的高度一致性.
- 使用Sentosa平台进行深度测序,与人口测序相比,在检测小HBV变种种群中表现出更高的灵敏度.
结论:
- 基于深度测序的ViroKey® SQ FLEX基因型鉴定试验在临床使用中是可靠的.
- 该试验可以在临床实践中自信地用于乙型肝炎基因型和耐药性测试.
