在使用基因组数据的环境出生体重变异性差异性选择下,在两种小鼠系中,对 litter 尺寸的同胞繁殖抑郁症

科学领域:

• 动物遗传学动物遗传学
• 量化遗传学 量化遗传学
• 人口遗传学 人口遗传学

背景情况:

• 亲生繁殖抑郁症 (ID) 降低了生存率和生育能力,其影响在不同种群之间有所不同.
• 对于环境出生体重变化的不同选择创造了高 (H线) 和低 (L线) 变化的小鼠线.
• 与H线相比,L线表现出优越的坚固性.

研究的目的:

• 用H线和L线小鼠的基因组和血统数据来估计子大小 (LS) 中的近亲繁殖抑郁症 (ID).
• 为了比较不同近亲繁殖措施对不同选择的小鼠线对LS的影响.
• 在选定的小鼠种群中识别与ID相关的基因组区域和近亲繁殖模式.

主要方法:

• 从26代的1587只小鼠的基因组DNA使用高密度SNP数组进行了分析.
• 使用了732只L线和648只H线动物的子大小数据.
• 基因谱 (FPED) 和各种基因组内生系数 (FNEJ,FL&H,FVR1,FVR2,FYAN,FROH,FHBD) 被计算和标准化.

主要成果:

• 基因组内生育对两条线的子大小都有负面影响,H线 (m=-3.71~-5.09) 的影响比L线 (m=-3.52~-4.55) 强.
• 显著的ID效应是局部化到CHR13在H线和CHR1和CHR9在L线.
• 最近的同卵性 (ROH) 和血统同卵性 (HBD) 分段对LS产生了负面影响,而较旧的分段显示出积极的影响,特别是在L-Line.

结论:

• 与H-Line相比,L-Line在内生抑郁症方面表现出更高的稳定性.
• 染色体1,9和13被确定为未来与近亲繁殖抑郁相关的基因关联研究的关键区域.
• 了解ROH和HBD年龄的影响对于在选择性繁殖计划中管理近亲繁殖至关重要.