解锁抗微生物:在蛋白解和人工智能驱动的发现中,来自Cnidarian Omics
Ricardo Alexandre Barroso1,2, Guillermin Agüero-Chapin1,2, Rita Sousa1,2
1Interdisciplinary Centre of Marine and Environmental Research (CIIMAR/CIMAR), University of Porto, Terminal de Cruzeiros do Porto de Leixões, Av. General Norton de Matos s/n, 4450-208 Porto, Portugal.
Molecules (Basel, Switzerland)
|February 13, 2025
概括
像珊瑚这样的海洋生物提供新的抗微生物 (AMP) 来对抗抗微生物耐药性 (AMR). 研究人员从111种鸟类中确定了3130种独特的,无毒的AMP,其中20种是进一步测试的有前途的候选物种.
科学领域:
- 海洋生物学 海洋生物学
- 生物技术是生物技术.
- 药物发现 药物发现
背景情况:
- 抗菌素耐药性 (AMR) 是一个重大的全球健康威胁.
- 海洋衍生抗微生物 (AMP) 是新型治疗药物的有希望的来源.
- 类动物拥有强大的先天免疫系统,使它们成为AMP的宝贵来源,但仍然未被充分探索.
研究的目的:
- 发现使用in silico方法从 cnidarian 种类中获得的新型抗菌 (AMPs).
- 与现有药物相比,识别具有毒性降低和独特结构的AMP.
- 评估这些新型AMP对关键病原体的潜力.
主要方法:
- 在蛋白解析中使用,分析来自111种类动物的奥米克数据.
- 采用浅层和深度学习模型来选数百万个.
- 进行复杂的网络分析以过非血液溶解和非有毒的AMP.
- 评估了对ESKAPEE病原体的假定抗菌活性.
主要成果:
- 识别了3130个独特的,非血液溶解的,非有毒的鱼类AMP的数据集.
- 发现了20个具有潜在抗菌活性的有前途的AMP候选物.
- 这些候选物适用于进一步的体外试验,对关键的病原体进行检测.
结论:
- 类动物代表了一个丰富的,未被探索的资源,用于新型抗菌素的发现.
- 在子查有效地确定了有希望的AMP候选者来对抗AMR.
- 已识别的AMP为抗生素开发提供了潜在的新途径,可以对抗具有挑战性的病原体.
