GWAS在果中发现了多胚胎位点:开发了KASP和PACE标记器,用于标记器辅助的繁殖

科学领域:

• 植物遗传学 植物遗传学
• 园艺科学 园艺科学
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 阿波米克斯可以通过来自母细胞的无性胚胎实现杂交的克隆传播.
• 果品种经常表现出阿波密克多胚胎,产生与母树遗传相同的幼苗.
• 目前的果根茎生产依赖于阿波米克特种子,这突显了对遗传理解和标记物开发的需要.

研究的目的:

• 为了识别与果 (Mangifera indica L.) 中多胚胎相关的分子标记物.
• 了解果中阿波米克斯的遗传基础.
• 开发用于在育种计划中选择多胚胎果后代的工具.

主要方法:

• 全基因组关联研究 (GWAS) 在果多样性小组上使用高密度单核酸多态 (SNP) 标志物进行.
• 在果和类多胚胎位点之间进行了比较基因组分析.
• SNP标记物被开发成基因型测试 (KASP和PACE) 并在繁殖种群中得到验证.

主要成果:

• 一个多胚胎位点被确定在链接组17,含有MiRWP/MiRKD4基因.
• 在果中29个SNP标记物和多胚胎之间发现了显著的关联.
• 开发的基因型定型试验证明了在各种果胚胎和繁殖群体中的实用性.

结论:

• MiRWP/MiRKD4基因和相关的SNP标记物对于理解和操纵果的尾作用至关重要.
• 这些分子工具促进了多胚胎幼苗的早期选择,加速了果育种工作.
• 确定的基因位和比较基因组学表明,在Rosids中,apomixis的进化机制得到了保护.