乳头微生物群和宿主基因组的变异影响了山羊品种的料效率
Alaa Emara Rabee1, Ibrahim Abou-Souliman2, Ahmed I Yousif3
1Animal and Poultry Nutrition Department, Desert Research Center, Cairo, Egypt.
Frontiers in microbiology
|February 13, 2025
概括
埃及Zaraibi山羊的料效率 (FE) 较高,这是由于其独特的小肠微生物和遗传标记. 这项研究有助于制定有针对性的育种策略,以改善山羊的FE.
科学领域:
- 动物遗传学和动物基因组学
- 微生物组研究 微生物组研究
- 类动物营养 类动物营养
背景情况:
- 提高料效率 (FE) 对于动物繁殖至关重要,但其与山羊品种的肠微生物群的关系尚不清楚.
- FE的变化可能会影响山羊养殖的经济可行性和畜牧业的可持续性.
研究的目的:
- 为了研究 rumen 微生物组和宿主基因组对 Shami (SH) 和 Zaraibi (ZA) 埃及山羊品种的料效率 (FE) 的影响.
- 识别与优质FE相关的遗传标记和微生物特征,以提高育种策略.
主要方法:
- 使用Illumina 65KSNP芯片阵列v2.2.进行10个SH和10个ZA山羊的基因定型.
- 通过16S rRNA基因PCR-amplicon测序对乳头细菌和古生物进行分析.
- 关联分析以确定影响FE的候选基因.
主要成果:
- 扎拉伊比山羊的FE显著高于沙米山羊.
- 在ZA山羊中观察到更高的纤维素/半纤维素降解细菌 (Bacteroidota,Fibrobacterota) 和碳水化合物/代谢属 (Prevotella,Lachnospiraceae) 的丰度.
- 确定了26个基因组窗口,其中有候选基因 (例如,FTO,LCAT) 与代谢,能量和营养物质的运输有关,有助于埃及山羊的FE.
结论:
- 特定的乳头微生物组成和遗传标记与埃及山羊品种的更高的料效率有关.
- 这些发现为利用遗传标记和微生物特征在山羊育种计划中进行改进FE的选择提供了基础.
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