转录组分析揭示了与常见的妇科癌症相关的多个与昼夜节律相关的基因
Lan Peng1, Meiping Jiang1, Kangming Li1
1Department of Radiation Oncology, The Third Affiliated Hospital of Kunming Medical University (Yunnan Cancer Hospital, Yunnan Cancer Center), Kunming, China.
Frontiers in oncology
|February 13, 2025
概括
循环节律相关基因 (CRRGs) 影响子宫癌 (CC) 的预后. 确定了包括APOBEC3B和UPP1在内的6种生物标志物,为妇科癌症机制和潜在的治疗点提供了洞察力.
科学领域:
- 基因组学和分子生物学
- 癌症研究 癌症研究
- 时间生物学 时间生物学
背景情况:
- 昼夜节律影响了人类一半以上的基因表达,包括对癌症生物学至关重要的基因.
- 昼夜节律相关基因 (CRRG) 在宫癌 (CC) 和其他妇科癌症中的特定作用尚不清楚.
研究的目的:
- 调查CRRGs在宫癌 (CC) 和其他常见的妇科癌症中的作用.
- 确定这些癌症中预后和治疗点的潜在生物标志物.
主要方法:
- 从公共数据库 (UCSC Xena, GEO) 分析了CC和妇科癌症的转录组和临床数据.
- 确定了差异表达的CRRG,随后进行了功能丰富分析.
- 使用选的生物标志物构建了一个生存风险模型,并进行了功能/瘤微环境分析.
主要成果:
- 六个RCRG (APOBEC3B,CDA,HELLS,RHOB,SLC15A3,UPP1) 被确定为CC预后的生物标志物.
- 这些生物标志物与皮里米丁代谢有关,并通过像细胞外矩阵 (ECM) 受体相互作用这样的途径影响CC.
- 高风险组显示免疫治疗敏感性较差,大多数生物标志物在其他妇科癌症中显示出预后价值.
结论:
- 六个CRRG作为CC和潜在的其他妇科癌症的预后生物标志物.
- 这些生物标志物与ECM受体相互作用和焦点粘附途径有关,影响癌症的进展.
- 这些发现提高了对妇科癌症病理学中的CRRG作用的理解,表明了针对性治疗的潜力.
