使用SPoRTS对活多细胞球体中的比度生物传感器进行时空空间分析
Matthew J Borrelli1, Bart Kolendowski2, Gabriel E DiMattia3
1The Mary and John Knight Translational Ovarian Cancer Research Unit, Verspeeten Family Cancer Centre, London, ON N6A 5W9, Canada; Department of Anatomy and Cell Biology, Western University, London, ON N6A 5C1, Canada.
Cell reports methods
|February 18, 2025
概括
我们开发了SPoRTS,这是一个自动化工作流程,用于分析3D细胞培养 (球体) 中的生物传感器活动. 这种方法准确地测量了球体中的细胞周期动态,与传统的增殖标志物相对应得很好.
科学领域:
- 细胞生物学 细胞生物学
- 生物技术是生物技术.
- 图像分析 图像分析
背景情况:
- 在3D细胞培养 (球体) 中分析生物传感器活动对于理解复杂的生物过程至关重要.
- 现有的用于球体中的生物传感器的时空分析方法可能是劳动密集型,缺乏自动化.
研究的目的:
- 引入SPoRTS (空间蛋白质和比度时间系统),这是一个开源的工作流程,用于高通量时空图像分析.
- 为了使生物传感器活动在活体球体内的半定量测量使用自动线路强度分析.
- 通过使用光,基于ubiquitin的细胞循环指标 (FUCCI) 系统分析细胞循环动态来验证SPoRTS.
主要方法:
- 开发一种自动化算法,从球形图像中获取线条强度概况数据.
- 实施SPoRTS工作流程,用于基于光的比度生物传感器的高通量分析.
- 活体球体体表达FUCCI生物传感器的空间分析以识别线粒细胞.
主要成果:
- SPoRTS能够自动,半定量测量生物传感器活动,作为距离球体中心的距离的函数.
- 对表达FUCCI的球状体的分析揭示了细胞周期活动的独特空间模式.
- 对SPoRTS的分析显示,与扩散标记的空间定量免疫染有很强的相关性.
结论:
- SPoRTS为球体中的生物传感器的高通量时空分析提供了一种高效和自动化的解决方案.
- 工作流可以在3D微环境中对生物过程进行半定量评估,例如细胞循环的进展.
- SPoRTS是促进发育生物学,药物发现和癌症研究研究的宝贵工具.
关键词:
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