在多种植物谱系中进行全面的Codon使用分析.
Aasim Majeed1, Vikas Sharma1, Wahid Ul Rehman1
1Molecular Genetics Laboratory, Department of Botany, Central University of Punjab, VPO Ghudda, Distt. Bathinda, Punjab, 151401, India.
植物进化显示出不同的密码子使用模式. 血管化,而不是种子生产,与最佳编码子的变化相关,非血管植物的突变压力更受影响.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 进化生物学 进化生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 的使用模式在各个生物体中各不相同,反映了进化适应.
- 了解这些模式可以了解基因组进化和选择性压力.
研究的目的:
- 为了研究植物进化事件 (血管化,种子生产) 和子使用模式之间的关系.
- 为了确定自然选择或突变压力是否主要影响不同植物系中的代号偏差.
主要方法:
- 在各种植物系中分析子使用模式.
- 应用对应分析和基于模型的聚类.
- 评估二核酸频率及其表示.
主要成果:
- 在非血管 (GC终结) 和血管 (AU终结) 植物谱系之间,最佳的编码区别不同.
- 的使用演变与血管化比种子生产更接近.
- CpG和TpA二核酸的含量不足;TpG的含量过多 (除藻类外).
- 与血管相比,突变压力对非血管血统有更大的影响.
结论:
- 血管化是一个关键的进化事件,在植物中塑造了子使用偏差.
- 自然选择和突变压力都影响了代码子的使用,在各个谱系中具有不同的相对重要性.
- 丁核酸组成为植物基因组的进化约束提供了进一步的线索.
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