一种完全基于下一代测序的分类子宫内膜癌分子亚型的方法保留了预后价值,并扩大了生物标记物标
Mark C Valentine1, Amanda Wong2, Ling Chen3
1Washington University School of Medicine in St. Louis, Department of Obstetrics and Gynecology, Division of Gynecologic Oncology, Siteman Cancer Center, St. Louis, MO, USA.
概括
一种新的下一代测序 (NGS) 试验准确地分类子宫内膜癌亚型,简化诊断并保持预后价值. 这种方法可以改善临床实施,并确定子宫内膜癌的新治疗点.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 分子诊断学 分子诊断
背景情况:
- 对于预后而言,子宫内膜癌分子分类为POLE-超突变,不匹配修复缺陷,p53-突变,没有特定的分子谱亚型至关重要.
- 目前的临床实施是不一致的,因为使用多个不同的测试需要集成.
- 一个基于下一代测序 (NGS) 的统一测试可以简化和标准化这种分类过程.
研究的目的:
- 开发和评估一种单一的,完全基于NGS的检测方法,用于子宫内膜癌分子亚型.
- 评估NGS测定与世界卫生组织 (WHO) 建立的算法的一致性.
- 评估基于NGS的亚型的预后价值,并探索潜在的治疗生物标志物.
主要方法:
- 使用经过验证的NGS小组 (133个基因,MSI,TMB) 对142个子宫内膜癌样本进行了回顾性分析.
- 使用世卫组织算法 (MMR/p53 IHC,POLE测序) 的并行分类.
- 评估一致性 (科恩的 κ),预后价值,并探索额外的生物标志物和种族差异.
主要成果:
- 在NGS测定和世卫组织算法之间具有很高的一致性 (136/142, κ=0.94).
- NGS试验对整体和无进展生存的预后有显著的价值.
- 确定了额外的预后 (CTNNB1) 和潜在的可向 (ERBB2) 变异;由于预后不佳的亚型,在黑人中发现了更差的结果.
结论:
- 一个完全基于测序的试验简化了子宫内膜癌的分子分类,保持了预后准确性.
- 这种方法可能会促进临床采用,并提供超出分类标记的更广泛的治疗见解.
- 来自NGS的基因组信息可以识别可操作的目标,并揭示癌症结果的差异.
