QPPLab:一种普遍适用的软件包,用于大规模检测,分析和可视化大脑活动的半周期性时空模式 (QPPs)
Nan Xu1,2, Behnaz Yousefi1, Nmachi Anumba1
1Wallace H. Coulter Department of Biomedical Engineering, Georgia Institute of Technology and Emory University, Atlanta, GA, United States.
SoftwareX
|February 20, 2025
概括
大脑活动中的准周期性模式 (QPPs) 现在更容易使用QPPLab进行研究,这是一个新的开源工具箱. 这种工具简化了功能神经成像数据的分析,提高了我们对大脑动态的理解.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 计算神经科学是一种神经科学.
- 神经成像分析分析 神经成像分析
背景情况:
- 准周期性模式 (QPPs) 是功能神经成像中观察到的大脑活动中的显著时空动态.
- QPP与注意力,兴奋和认知功能等神经过程有关.
- 目前的QPP分析工具受到研究特定参数和复杂的工作流程的限制.
研究的目的:
- 介绍QPPLab,这是一个开源的MATLAB工具箱,用于从fMRI时间序列检测,分析和可视化QPP.
- 为研究QPP提供一个用户友好和高效的解决方案,克服现有工具的局限性.
主要方法:
- QPPLab使用基于相关性的代算法来检测QPP.
- 该工具箱支持可自定义的参数设置和自动化工作流程.
- 提供不同的检测模式,快速模式比强大模式快4-6倍.
主要成果:
- QPPLab生成时空QPP模板,滑动相关时间课程和功能连接地图.
- 该工具箱通过减少手动参数调整来简化分析过程.
- 在各种数据集和物种中展示有效的QPP分析.
结论:
- QPPLab提高了功能神经成像中的QPP分析的效率和可访问性.
- 促进对内在大脑动态及其认知相关的更广泛的研究.
- 使研究人员能够更轻松地在各种数据集和物种中调查QPP.
