基于生物库规模数据的哈普类型并行PBWT

Kecong Tang1, Ahsan Sanaullah1, Degui Zhi2

  • 1Department of Computer Science, University of Central Florida, Orlando, FL 32826, USA.

概括

一个新的并行算法,HP-PBWT,通过并行定位布罗斯-惠勒变换 (PBWT) 加快了哈普类型匹配. 这使得大型单元型组的有效分析成为可能,这对于人口遗传学和基因组学研究至关重要.