在中国白菜中查尔康合成酶基因家族的全基因组识别,特征和表达分析
Ziwei Xie1, Lei Yang1, Mi Fan1
1State Key Laboratory of North China Crop Improvement and Regulation, Key Laboratory of Vegetable Germplasm Innovation and Utilization of Hebei, Ministry of Education of China-Hebei Province Joint Innovation Center for Efficient Green Vegetable Industry, College of Horticulture, Hebei Agricultural University, Baoding, 071000, China.
BMC genomics
|February 20, 2025
概括
鉴定出了十个中国白菜石灰合成酶 (CHS) 基因. BrCHS4对于黄和素的积累至关重要,为紫色中国卷心菜的繁殖提供了潜力.
科学领域:
- 植物分子生物学 植物分子生物学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 胆合成酶 (CHS) 是黄类生物合成中的一个重要酶.
- 黄酸对植物发育和耐压力至关重要.
- 中国白菜CHS基因家族 (BrCHS) 之前没有被鉴定.
研究的目的:
- 为了识别和表征中国白菜中的BrCHS基因家族.
- 为了研究BrCHS基因在黄和素积累中的功能.
主要方法:
- 对BrCHS基因的全基因组识别.
- 对 BrCHS 蛋白质的遗传学分析.
- 对BrCHS促进体中cis作用元素的分析.
- 在压力条件下的基因表达分析.
- 病毒诱导的基因沉默 (VIGS) 来评估BrCHS4的功能.
主要成果:
- 在7个染色体中发现了10个BrCHS基因.
- BrCHS蛋白质具有保存的Chal_Sti_Synt域,并形成两个进化群.
- BrCHS基因促进体含有多种不同的cis作用元素.
- 在甲基斯酸盐,盐和干旱压力下,BrCHS2和BrCHS8的表达增加.
- 沉默 BrCHS4 降低了叶子中的黄类和素含量.
结论:
- 中国卷心菜拥有十个 BrCHS 基因,具有保存的进化特征.
- BrCHS4在积累黄和酸方面发挥着重要作用.
- 已识别的BrCHS基因是繁殖紫色中国白菜品种的候选者.
更多相关视频
10:40Comprehensive Workflow for the Genome-wide Identification and Expression Meta-analysis of the ATL E3 Ubiquitin Ligase Gene Family in Grapevine
Published on: December 22, 2017
10.4K
08:09Development of a Cabbage Protoplast System for Studying Hypoxia Tolerance in Brassica
Published on: September 20, 2024
390
