针对法医应用的有针对性和灵活的表观遗传钟的可复制性和验证
Ersilia Paparazzo1, Mirella Aurora Aceto1, Teresa Serra Cassano2
1Department of Biology, Ecology and Earth Sciences, University of Calabria, Rende 87036, Italy.
Forensic science international
|February 21, 2025
概括
这项研究验证了一种针对性表观遗传时钟,用于使用DNA甲基化方法准确测量血液样本中的时间年龄. 高效的SNaPshot测定方法与现有方法具有很高的相关性,提供了具有成本效益的衰老生物标志物.
科学领域:
- 表观遗传学和衰老研究研究.
- 生物标志物开发 生物标志物开发
背景情况:
- DNA甲基化变体作为生物年龄估计的生物标志物.
- 使用有限数量的CpG位点的有针对性的方法正在简化表观遗传钟.
研究的目的:
- 测试针对性表观遗传钟的可重现性和验证性,用于测量血液中的时间年龄.
- 评估用于年龄预测的多重甲基化SNaPshot试验的效率和可负担性.
主要方法:
- 使用DNA甲基化生物标记物 (ELOVL2,FHL2,KLF14,C1orf132/MIR29B2C,TRIM59) 开发和应用一个向的表观遗传钟.
- 在201个血液样本中通过多重甲基化SNaPshot试验测量DNA甲基化水平.
- 为了比较,使用Illumina Methylation EPIC v2.0套件进行全基因组甲基化分析.
主要成果:
- 开发的表观遗传时钟显示,在广泛的年龄范围内,与时间年龄有很高的相关性 (r=0.97).
- 在SNaPshot测定结果和Illumina EPIC阵列数据之间观察到强烈的相关性,特别是在Horvath2时钟.
- 目标时钟证明了在多个CpG站点同时测量DNA甲基化的效率和可负担性.
结论:
- 经过验证的向表观遗传时钟是一种可靠和有效的工具,用于评估血液样本中的时间年龄.
- 该SNaPshot测定为测量关键的DNA甲基化生物标志物对衰老提供了成本有效的替代方案.
