通过加密口袋映射加上X射线片段查,加强了与hnRNPA1结合的小分子的识别
Louise Dunnett1, Sayan Das2, Vincenzo Venditti2
1Diamond Light Source Ltd., Harwell Science and Innovation Campus, Didcot, UK.
The Journal of biological chemistry
|February 21, 2025
概括
研究人员在hNRNPA1蛋白中发现了可用药物的口袋.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 结构生物学 结构生物学
- 药物发现 药物发现 药物发现
背景情况:
- 人类异质核核核糖核蛋白 (hnRNP) A1对于RNA代谢至关重要.
- hnRNPA1的失调与神经退行性疾病和癌症有关.
研究的目的:
- 确定能够与hNRNPA1的N端RNA结合域 (UP1) 结合的小分子.
- 验证可使用药物的热点,以开发针对 hnRNPA1.1 的新疗法.
主要方法:
- 分子动力学模拟的模拟.
- 图表神经网络口袋预测
- 在UP1蛋白质晶体上进行碎片选.
主要成果:
- 在 hnRNPA1 UP1 域中识别了加密口袋.
- 发现了36个与UP1.1的功能区域结合的碎片.
- 观察到连接体诱导的构造变化和绘制新的相互作用表面.
结论:
- 首个高分辨率的hNRNP结构与小分子复合在一起.
- 为开发hnRNPA1抑制剂和化学工具提供了基础.
- 能够为 hnRNPA1 介导的疾病开发合理的药物.
