干血斑作为分子流行病学研究的替代样本,用于HCV/HIV共感染患者
Geane Flores1, Barbara Vieira Lago2, Amanda R Caetano1
1Instituto Oswaldo Cruz (Fiocruz), Laboratório de Hepatites Virais, Rio de Janeiro, RJ, Brazil.
概括
现场干血 (DBS) 样本对于跟踪共感染个体的C型肝炎病毒 (HCV) 遗传多样性非常有效. 这种方法有助于在脆弱人群中进行病毒基因组监测,改善了对诊断和治疗的准入.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 公共卫生 公共卫生
- 分子流行病学分子流行病学
背景情况:
- 型肝炎病毒 (HCV) 和人类免疫缺陷病毒 (HIV) 分享传播途径,使病毒性肝炎的消除工作复杂化.
- 据估计,全球约有230万个人携带艾滋病毒/HCV联合感染,往往生活在资源有限的环境中.
- 现场干血 (DBS) 采样为这些人群的诊断和治疗提供了可行的替代方案.
研究的目的:
- 评估与艾滋病毒同时感染的人群中HCV的遗传变异性.
- 为了对配对血清和DBS样本的发现进行HCV分子追踪.
- 评估DBS在脆弱人群中HCV的基因组监测中的实用性.
主要方法:
- 来自配对血清和DBS样本的HCV NS5B基因序列的家族遗传学分析.
- 从巴西里约热内卢的14名HIV/HCV同时感染的个体获得HCVRNA的RT-PCR放大和测序.
- 在样本类型之间比较HCV基因型分布和耐药性相关突变.
主要成果:
- 在血清和DBS样本之间观察到高一致性,用于HCV遗传特征 (遗传距离:0.0到0.16).
- 确定的主要HCV基因型/亚基因型是1a,1b,3a和4d.
- 在三个个体的两个样本类型中检测到316N抗性相关突变 (RAS).
结论:
- 现场干血 (DBS) 适用于HIV/HCV同时感染患者中HCV的分子追踪.
- 在关键和脆弱人群中,DBS促进了病毒基因组监测.
- 这种方法提高了HCV诊断和治疗监测的可访问性.
