QAAPT:一个可互操作的基于Web的开源工具,用于分析和可视化抗微生物耐药性数据
Mohammad Julhas Sujan1, Sanjay Gautam1, Ahmed Taha Aboushady2
1Department of Antimocrobial Resistance, International Vaccine Institute, Seoul, Republic of Korea.
Frontiers in microbiology
|February 24, 2025
概括
一个新的开源工具,抗微生物模式和趋势的快速分析 (QAAPT),简化了抗微生物耐药性 (AMR) 数据的分析和可视化. 这个用户友好的应用程序有助于低资源设置有效跟踪AMR趋势.
科学领域:
- 公共卫生 公共卫生
- 传染病流行病学 传染病流行病学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 对抗生素耐药性 (AMR) 的监测至关重要,特别是在面临高负担的低收入和中等收入国家.
- 有效分析和可视化AMR数据在这些地区存在重大挑战.
研究的目的:
- 描述抗微生物模式和趋势快速分析 (QAAPT) 工具的设计,开发,整合和实施.
- 为AMR数据分析和可视化提供开源,用户友好的解决方案.
主要方法:
- 开发了一个开源的,基于Web的应用程序 (QAAPT) 用于AMR数据分析和可视化.
- 综合数据策划选项和与实验室信息管理系统的兼容性.
- 与具有有限编程专业知识的个人测试了该工具的可用性.
主要成果:
- 在亚洲7个国家的72个实验室成功实施了QAAPT工具.
- 分析了超过237万个异构的抗微生物敏感性测试数据点.
- 生成统计和视觉输出,证明该工具在处理大型,复杂的AMR数据集的能力.
结论:
- QAAPT工具为AMR监测数据的分析和可视化提供了一个实用且易于使用的解决方案.
- 促进对抗微生物药物耐药性的更好理解和管理,特别是在资源有限的环境中.
- 该工具的开源性质和易用性促进了在全球AMR努力中更广泛的采用和协作.
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