多基因在分析确定TM4SF4作为肝细胞癌的细胞表面标
Kah Keng Wong1, Suzina Sheikh Ab Hamid2,3
1Department of Immunology, School of Medical Sciences, Universiti Sains Malaysia, Kubang Kerian, Kelantan, Malaysia.
PloS one
|February 25, 2025
概括
研究人员确定TM4SF4是肝细胞癌 (HCC) 免疫疗法的有前途的细胞表面标. 这个目标在HCC细胞中表达高,但在正常组织中存在极少,可能减少副作用.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫治疗是一种免疫疗法.
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 肝细胞癌 (HCC) 细胞免疫疗法面临挑战,因为缺乏特定的细胞表面点.
- 识别具有高HCC表达和低正常组织表达的目标至关重要,以最大限度地降低目标外瘤毒性.
研究的目的:
- 用in silico multomics分析识别和验证HCC免疫治疗的最佳细胞表面标.
- 评估HCC和正常组织中潜在标的表达特征.
主要方法:
- 在人类蛋白质图谱数据库 (12,948 个基因) 的 in silico multomics 分析.
- 根据HCC (n=791) 中的转录和蛋白质表达,在四个数据集中列出了八个候选基因的简单列表和排名.
- 使用单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和免疫组织化学进行验证.
主要成果:
- TM4SF4被确定为排名最高的目标,与其他七个常见的HCC目标相比,HCC表达明显更高.
- TM4SF4在正常的人体组织中表达受限,在免疫细胞中不存在,主要位于肝细胞胆道道中.
- 在HCC细胞中的TM4SF4表达与线粒体功能和氧化酸化途径相关.
结论:
- 由于其在癌细胞中的特定表达模式,TM4SF4是HCC免疫疗法的有前途的细胞表面标.
- 它与瘤性途径的关联表明它在HCC进展和潜在的治疗脆弱性中发挥了作用.
