在感染了monilinia laxa的Prunus persica水果中选择稳定的参考基因,以规范RT-qPCR基因表达数据
Agata Lizzio1,2,3, Valerio Battaglia4, Ernesto Lahoz4
1CREA Council for Agricultural Research and Economics, Fruit and Citrus Crops (CREA-OFA), Olive, Caserta, Italy. agata.lizzio@crea.gov.it.
Scientific reports
|February 25, 2025
概括
这项研究确定了与真菌病原体Monilinia laxa.相互作用的桃子中的基因表达分析的稳定参考基因. 建议AKT3,RNA pol II (RPII) 和SNARE用于在这种病理系统中准确的RT-qPCR正常化.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 分子生物学分子生物学
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 在桃子 (Prunus persica) 中精确的基因表达量化对于理解与Monilinia laxa的相互作用至关重要,这是一种引起棕色腐烂的病原体.
- 已建立的参考基因 (RG) 在这种病理系统中对于可靠的反转录量PCR (RT-qPCR) 分析至关重要.
研究的目的:
- 识别和验证稳定的基因参考RT-qPCR正常化在桃花在蒙尼利尼亚 laxa感染期间.
- 为未来关于这种植物病原体相互作用的分子研究提供可靠的参考基因组.
主要方法:
- 使用 ΔCq 方法和 geNorm,NormFinder 和 BestKeeper 算法评估了 12 个候选参考基因的稳定性.
- 在注射后的不同时间点 (12至144 HAI) 分析了桃子水果的样本.
- 通过在接种和未接种的桃子水果中正常化六个基因的表达来验证选定的参考基因.
主要成果:
- AKT3,RNA pol II (RPII) 和SNARE被确定为跨多个算法中最稳定的参考基因.
- geNorm算法表明,三个参考基因足以进行准确的正常化.
- 经过验证的参考基因使目标基因表达的可靠正常化成为可能,证实了它们的适用性.
结论:
- AKT3,RPII和SNARE被推作为一种强大的参考基因组,用于在桃花-Monilinia laxa相互作用中的RT-qPCR分析.
- 这些验证的参考基因将提高基因表达研究的准确性和可靠性,在这个重要的病理系统.
- 这些发现有助于更深入地了解控制桃子棕色腐烂疾病的分子机制.
更多相关视频
08:08Determination of Self- and Inter-incompatibility Relationships in Apricot Combining Hand-Pollination, Microscopy and Genetic Analyses
Published on: June 16, 2020
7.2K
07:03Establishing Pollination Requirements in Japanese Plum by Phenological Monitoring, Hand Pollinations, Fluorescence Microscopy and Molecular Genotyping
Published on: November 9, 2020
3.0K
