在加纳环境样本中评估摩尔和抓取样本检测沙门氏菌Typhi检测方法
Michael Owusu1, Eric Darko1, Debora Akortia1
1Kwame Nkrumah University of Science and Technology, Kumasi, Ghana.
PloS one
|February 26, 2025
概括
使用废水进行的环境监测检测到加纳的Salmonella enterica serovar Typhi (S.Typhi),为监测伤寒热提供了一种低成本的替代血液培养方法. 这种方法显示S.Typhi的流行率高于临床监测,突出了其在公共卫生干预方面的潜力.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 公共卫生 公共卫生
- 传染病监测 传染病监测 传染病监测 传染病监测
背景情况:
- 在低收入和中等收入国家 (LMICs) 中,由于水,环境卫生和卫生条件差,伤寒仍然是严重的健康负担.
- 血培养,黄金标准的伤寒诊断,往往是难以接近和昂贵的LMICs.
- 环境监测 (ES) 提出了一种具有成本效益的策略,用于检测沙门氏菌 (Salmonella enterica) 血清型Typhi (S.Typhi) 的循环和告知干预措施.
研究的目的:
- 在加纳的郊区社区实施和评估S.Typhi的环境监测.
- 为了比较不同废水采样方法 (取样与摩尔拭子) 对于S.Typhi检测的有效性.
- 评估S.Typhi环境检测和临床台风病例之间的相关性.
主要方法:
- 从2022年7月到2023年8月,加纳的40个地点部署了标准化的ES协议.
- 在前六个月,每月采集抓取样本 (GS) 和摩尔片 (MS),随后每月采集MS.
- 多重定量PCR (qPCR) 用于检测废水样本中的S.Typhi目标基因和人类便污染生物标志物 (Bacteroides HF183). 临床监测包括发烧病例的血液培养物.
主要成果:
- 摩尔片 (MS) 在最初的六个月内显示S.Typhi (42%) 与取样 (GS) (10%) 相比,S.Typhi的流行率显著更高 (p < 0.001).
- 在研究期间,MS中S.Typhi总体检测率为42.1%,与0.21%的临床监测患病率形成对比.
- 降雨量和湿天的数量与废水中S.Typhi检测的几率增加有关.
结论:
- 基于废水的环境监测,特别是使用摩尔扫描仪,有效地检测到了加纳的S.Typhi循环.
- 临床监测中的较低检测率可能受到寻求医疗保健的行为和早期抗生素使用的影响.
- 需要进一步的研究,包括安普利康测序和整合策略,以优化ES用于预防伤寒的公共卫生决策.
