整合微生物分类学和功能特征的时间动态作为法医时间的工具,自沉积估计以来的时间
Qiong Lan1, Xiaolian Wu2, Qinglin Liu2
1Guangzhou Key Laboratory of Forensic Multi-Omics for Precision Identification, School of Forensic Medicine, Southern Medical University, Guangzhou, China; Microbiome Medicine Center, Department of Laboratory Medicine, Zhujiang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou, China.
Forensic science international
|February 26, 2025
概括
使用微生物数据预测唾液污点沉积以来的时间 (TsD) 对法医调查至关重要. 这项研究表明,结合微生物分类学和功能概况,可以准确估计唾液污染年龄,帮助犯罪现场分析.
科学领域:
- 法医科学 法医科学 法医科学
- 微生物学 微生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 在法医调查中,准确预测生物污点沉积以来的时间 (TsD) 是至关重要的.
- 之前的研究确定了微生物种群作为TSD预测的指标.
- 人的唾液微生物组在法医背景下为时间分析提供了一个潜在的来源.
研究的目的:
- 探索人类唾液微生物组的分类学和功能特征的联合使用,用于TSD预测.
- 研究微生物群落的时间动态与唾液污点的TSD之间的相关性.
- 开发和验证用于估计唾液污点年龄的预测模型.
主要方法:
- 微生物群落组成的分析,使用片序列变异 (AsVs) 和微生物种类的相对丰度.
- 评估唾液污点微生物组内的代谢功能途径概况.
- 组合模型的开发,将分类学和功能数据与机器学习算法 (例如,xgboost) 整合在一起.
主要成果:
- 微生物代谢功能通路概况的变化与唾液污染年龄有显著的相关性.
- 使用微生物属和代谢途径的整体模型实现了高精度 (R2 = 0.76,MAE = 6.28天) 的TSD预测到60天.
- 确定了对TD估计的潜在微生物生物标志物.
结论:
- 这项研究提供了使用多模式数据 (分类学和功能) 进行TsD预测老唾液污点的第一个证据.
- 整合微生物功能配置文件可以提高唾液污染年龄估计的准确性.
- 这种方法为涉及唾液证据的法医调查提供了宝贵的见解和工具.
