利用斑马鱼胚胎的表型观测来推进毒理学中数据驱动的分析
Paul Michaelis1, Nils Klüver1, Silke Aulhorn1
1Department Ecotoxicology, Helmholtz Centre for Environmental Research - UFZ, Permoserstraβe 15, 04318 Leipzig, Germany.
Environmental science & technology
|February 27, 2025
概括
斑马鱼胚胎毒性测试由毒理观察综合效应数据库 (INTOB) 改进. 这种标准化数据管理工具提高了数据的可比性,以进行可靠的化学风险评估.
科学领域:
- 毒理学 毒理学 毒理学
- 生态毒理学 生态毒理学
- 药物开发 药物开发
背景情况:
- 斑马鱼胚胎对于毒理学研究至关重要,因为有监管豁免.
- 目前斑马鱼胚胎检测协议中的不一致性阻碍了数据分析.
- 对于元分析和跨研究比较,需要标准化的数据格式.
研究的目的:
- 为标准化斑马鱼胚胎毒性数据收集开发数据管理工具.
- 提高毒性数据的可比性和互操作性.
- 通过系统的数据利用,推进化学风险评估.
主要方法:
- 开发用于毒理学观察的综合效应数据库 (INTOB).
- 使用受控词汇对元数据和表型观测的标准化.
- 将来自600多个实验的数据纳入数据库.
主要成果:
- INTOB提高了斑马鱼毒性数据的可比性和互操作性.
- 斑马鱼胚胎急性毒性测试 (ZFET) 检测到7个数量级的毒性.
- 基于形态指纹的交叉阅读分析与化学作用模式相关.
结论:
- 使用INTOB的专业数据管理显著推进了对斑马鱼胚胎毒性数据的系统使用.
- 标准化数据可以实现更可靠,数据驱动的化学风险评估.
- 提供FAIR数据集和分析工作流程的目的是为了更广泛的科学用途.
