高通量肠道微生物组研究中的人类非向代谢学:乙醇与甲醇
Simone Zuffa1,2, Vincent Charron-Lamoureux1,2, Caitriona Brennan3,4
1Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, University of California San Diego, La Jolla, California 92093, United States.
Analytical chemistry
|February 27, 2025
概括
这项研究引入了一种使用95%乙醇进行便样本采集和储存的安全有效的方法,为肠道微生物组研究保存代谢资料. 这种方法增强了便代谢学数据的高通量分析.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 代谢学 代谢学 代谢学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 人体便样本的非向代谢学对于理解肠道微生物群的功能至关重要.
- 目前的样本采集方法需要适应安全,高吞吐量和家庭样本采集.
研究的目的:
- 评估95%乙醇作为便代谢学安全有效的提取溶剂.
- 评估储存在95%乙醇中的便代谢物的稳定性.
- 为可靠的非目标代谢学提出数据分析工作流程.
主要方法:
- 95%乙醇和50%甲醇提取之间的代谢物回收的比较.
- 在室温下在95%乙醇中存储长达一周后,评估便代谢组稳定性.
- 应用中心日志比率转换用于数据规范化.
主要成果:
- 95%乙醇提取回收的可比代谢物数量为50%的甲醇,保留了代谢特征的差异.
- 在室温下在95%乙醇中储存长达一周时,便代谢组保持稳定.
- 中心日志比率转换有效地使代谢学数据正常化,考虑到样本重量和度变化.
结论:
- 95%乙醇是适合于安全,批量,现场外便样本采集的溶剂.
- 拟议的数据分析工作流确保可靠和整合准备的非目标代谢学数据用于肠道微生物组研究.
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