通过全面的分子诊断来挑战传统的诊断方法:在患有ALL的儿童中进行全国范围的前景比较

科学领域:

• 血液学 血液学 血液学
• 在瘤学瘤学.
• 分子诊断学 分子诊断

背景情况:

• 急性淋巴细胞白血病 (ALL) 治疗分层依赖于各种遗传异常.
• 准确及时检测这些异常对于有效的患者管理至关重要.
• 当前的诊断工作流程可能需要多次测试,影响周转时间.

研究的目的:

• 通过评估各种分子测试,优化ALL的诊断工作流程.
• 确定一组有限的测试,可以在临床相关的时间范围内检测出所有相关的遗传异常.
• 为了比较不同诊断方法的技术成功,一致性和周转时间.

主要方法:

• 一项前性研究涉及467名儿科和年轻成人ALL患者 (0-20岁).
• 对比RNA测序 (RNAseq),光在位杂交 (FISH),逆转录酶聚合酶链反应 (RT-PCR),型化,单核酸多态化 (SNP) 阵列和多重结合依赖探头放大 (MLPA).
• 对每种方法的技术成功,结果一致性和周转时间的评估.

主要成果:

• 在检测关键基因融合方面,RNAseq和FISH实现了高一致性 (99%).
• 在SNP阵列中,SNP阵列在检测形状和缺失方面表现出了优于型的性能.
• 结合RNAseq和SNP阵列方法检测到所有分层遗传异常,周转时间小于15天.
• 在B细胞前体ALL和T-ALL病例中,RNAseq在很大一部分病例中发现了新的基因融合.

结论:

• 与目前的方法相比,结合RNAseq和SNP阵列为检测ALL中的遗传异常提供了优越的诊断策略.
• 这种综合方法满足了关键的治疗决策时间点,周转时间小于15天.
• 综合方法还有利于发现新的遗传病变,有助于未来的ALL预后和病理生物学研究.