预测甲基和多基化合物的线粒体标相互作用:绘制斑马鱼电压依赖性离子通道2的线粒体毒性
Michael González-Durruthy1, Amit K Halder1, Ana S Moura1
1LAQV@REQUIMTE/ Department of Chemistry and Biochemistry, Faculty of Sciences, University of Porto, Porto 4169-007, Portugal.
Aquatic toxicology (Amsterdam, Netherlands)
|March 2, 2025
概括
计算方法通过分析与zfVDAC2通道的相互作用,准确地预测斑马鱼中的和多基物质 (PFAS) 生态毒性. 这种方法与环境风险评估的新方法方法 (NAM) 保持一致.
科学领域:
- 环境科学 环境科学
- 毒理学 毒理学 毒理学
- 计算化学的计算化学
背景情况:
- 生态系统面临着越来越多的污染物威胁,如和多基基物质 (PFAS).
- 可靠的生态毒性预测对于评估对水生生物和人类健康的风险至关重要.
- 计算生态毒理学为传统方法提供了一个可行的替代方案,与新方法方法 (NAMs) 保持一致.
研究的目的:
- 以计算方式评估PFAS与斑马鱼线粒体电压依赖离子通道2 (zfVDAC2) 的毒动力学相互作用.
- 使用in silico方法预测水生生物体中的PFAS生物积累和毒性机制.
- 评估这些计算模型对PFAS风险评估和监管建议的重要性.
主要方法:
- 基于结构的虚拟选 (SB-VS) 将PFAS分子接到zfVDAC2结合部位.
- 开发2D/3D定量结构-活性关系 (QSAR) 模型,用于线粒毒性预测.
- 结合相互作用 (范德瓦尔斯键,键,键) 和分子描述物的分析.
主要成果:
- 排名第一的PFAS分子对zfVDAC2的结合亲和力比ATP更高,这表明竞争性抑制.
- 范德瓦尔斯相互作用占主导地位,其次是-素和键.
- 包装密度指数成为PFAS诱导的zfVDAC2毒性的关键分子描述指标.
结论:
- 结合SB-VS和QSAR的计算生态毒理学有效地预测了斑马鱼的PFAS线粒毒性.
- PFAS毒性可能涉及通过zfVDAC2阻止线粒体ATP运输,可能是通过局部灵活性干扰.
- 开发的模型证明了NAM的相关性,为更广泛的生态毒理学评估提供互操作性和推断能力.
