一个关于NFKB1/NFKB2淘汰赛Jurkat细胞和由CRISPR/Cas9介导的基因破坏产生的初级CD4+T细胞的数据集
Erika Osada1, Yoshinobu Manome1, Yohei Sato1
1Core Research Facilities, Research Center for Medical Sciences, The Jikei University School of Medicine, Tokyo, Japan.
Data in brief
|March 3, 2025
概括
调查核因子-kappa B (NF-kB) 在T细胞中的信号传递,这项研究使用了CRISPR/Cas9基因编辑. NF-kB1/NF-kB2淘汰细胞表现出类似的静止状态表型和基因表达特征.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 分子生物学分子生物学
- 细胞生物学 细胞生物学
背景情况:
- 人类T细胞中非正规核因子-kappa B (NF-kB) 信号通路的特定生物学作用尚未完全理解.
- NF-kB信号传递对T细胞激活,分化和生存至关重要,但其在休息T细胞中的精确功能需要进一步阐明.
研究的目的:
- 在人类T细胞中基因研究NF-kB信号传导,特别是NFKB1和NFKB2的生物学作用.
- 了解NFKB1和NFKB2基因淘汰对T细胞表型和基因表达特征的影响.
主要方法:
- 使用聚类正规间隔的平行体重复 (CRISPR) /CRISPR相关蛋白9 (Cas9) 基因编辑技术.
- 基因改造的Jurkat白血病细胞和原始人类CD4+T细胞,以击败NFKB1和NFKB2位点.
- 使用定量聚合酶连锁反应 (qPCR) 和光激活细胞分类 (FACS) 进行分析.
主要成果:
- 在NFKB2-被淘汰的细胞中观察到IKAROS家族指-2的下调,而在没有刺激的NFKB1-被淘汰的细胞中观察到上调.
- 在原始人类CD4+T细胞中,CRISPR/Cas9介导的NFKB1和NFKB2的淘汰导致了在静止状态下类似的表型和基因表达特征.
- 在Jurkat细胞中的NFKB1/NFKB2双击也表现出明显的基因表达变化.
结论:
- 在T细胞中,NF-kB1和NFKB2在调节IKAROS家族指-2表达方面发挥着不同的作用.
- 人类CD4+T细胞中NFKB1/NFKB2的基因编辑导致可比的表型和静止时的基因表达特征,这表明在没有激活信号的情况下具有协调或冗余的作用.


