基于微阵列数据分析,分子对接和动态模拟的基础上,识别和评估与免疫透和潜在结核病中药物相互作用相关的枢纽基因和miRNAs协调
PhongSon Dinh1, ChauMyThanh Tran1, ThiPhuongHoai Dinh2
1College of Medicine and Pharmacy, Duy Tan University, Danang, 550000, Viet Nam.
Biochemistry and biophysics reports
|March 4, 2025
概括
了解从潜伏到活跃结核病 (TB) 的转变至关重要. 这项研究确定了参与结核病进展的关键基因和miRNA,并建议潜在的抗炎药物用于治疗.
科学领域:
- 基因组学和分子生物学
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 计算生物学 计算生物学
背景情况:
- 结核病 (TB) 是一个重要的全球卫生问题,从潜伏到活跃的疾病的过渡仍然不太了解.
- 有效的结核病临床管理和预防策略需要更深入地了解其进展机制.
- 来自不同结核病阶段的个体的高通量测序数据为分子调查提供了宝贵的资源.
研究的目的:
- 阐明从潜伏性结核病过渡到活跃性结核病的分子机制.
- 确定关键基因和微RNA (miRNAs) 作为结核病诊断,监测和治疗的潜在生物标志物.
- 发现针对结核病炎症途径的新型治疗剂.
主要方法:
- 差异基因和miRNA表达分析使用高通量测序数据和R包 limma.
- 基因本体学 (GO) 和基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 分析功能丰富的途径.
- 使用Cytoscape的网络可视化,用于基因验证的接收器操作特征 (ROC) 分析,以及用于药物验证的分子动态模拟 (MM-GBSA,PCA).
主要成果:
- 关键基因 (PLEKHG1,CLPB,DOK4,IL1β,TLR3) 的鉴定,这些基因与潜伏到活跃的结核病过渡有关,与免疫反应和多细胞生物体过程有关.
- 构建一个中央调节miRNA网络,提供有关结核病原体的见解.
- 选塞拉斯和无水作为潜在的针对IL1β的抗炎药物,通过分子动力学模拟进行验证.
结论:
- 这项研究增强了对潜在结核病进展的理解,并确定了结核病的新型分子生物标志物.
- 这些发现提供了潜在的治疗策略,包括抗炎药物,以对抗结核病引起的炎症.
- 已识别的基因和miRNA对复杂疾病和个性化医学的研究具有更广泛的意义.
