作为不侵入性多发性硬化症生物标志物的循环无细胞DNA甲基化资料:一项概念验证研究
Hailu Fu1,2, Kevin Huang3, Wen Zhu4
1Department of Biochemistry and Molecular Genetics, Feinberg School of Medicine, Northwestern University, Chicago, IL 60611.
medRxiv : the preprint server for health sciences
|March 4, 2025
概括
血中无细胞DNA甲基化为多发性硬化症 (MS) 诊断,亚型分类和预测疾病进展提供了一种新的非侵入性生物标志物,其表现优于目前的标志物.
科学领域:
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 神经免疫学 神经免疫学
- 生物标志物发现发现
背景情况:
- 多发性硬化症 (MS) 缺乏用于全面疾病评估的非侵入性生物标志物.
- 目前的方法难以同时分类亚型,评估残疾并预测进展.
研究的目的:
- 为了研究无血细胞DNA (cfDNA) 甲基化概况的临床实用性.
- 评估cfDNA甲基化以区分MS与对照,识别亚型和预测残疾.
- 评估cfDNA甲基化作为一个单一的,非侵入性诊断和预后测定.
主要方法:
- 75个血cfDNA样本的低覆盖全基因组二硫酸盐测序 (WGBS).
- 差异甲基化CpG和区域 (DMR) 的识别和分析.
- 与神经丝光链 (NfL) 和GFAP相比,cfDNA甲基化性能的比较.
主要成果:
- 成千上万的DMR显著区分了MS患者与对照者,并分层化了MS亚型和残疾水平.
- DMRs富含免疫和神经调节元件,其动机与神经元功能和T细胞分化有关.
- 在区分MS亚型和严重程度方面,cfDNA甲基化表现优于NfL和GFAP (AUC 0.67-0.82).
- 通过cfDNA甲基化识别的预后区域高准确度预测了未来的残疾 (AUC=0.81).
结论:
- 流通中的cfDNA甲基化档案显示出作为MS的非侵入性生物标志物的巨大潜力.
- 这种方法可能使MS的同时诊断,亚型分类和预后成为可能.
- 需要通过更深度的测序和独立的队列进行进一步的验证.
