尺寸分数告诉微生物社区的组成和相互作用在东部热带北太平洋的东部太平洋

科学领域:

• 海洋微生物生态学
• 海洋生物地质化学循环
• Prokaryotic 和真菌相互作用.

背景情况:

• 海洋微生物是全球生物地化学循环的关键驱动因素,特别是在氧气最小区 (OMZ).
• 了解微生物社区的结构和相互作用对于了解海洋健康和功能至关重要.

研究的目的:

• 调查东部热带北太平洋OMZ中的 prokaryotic 社区及其与真菌的相互作用.
• 为了分析微生物社区的组成,跨越垂直氧气梯度和不同的粒子大小分数.

主要方法:

• 对16S rRNA基因的元编码调查.
• 沿着垂直氧气梯度收集水样.
• 三个阶段的大小分片过 (0.22,2,和22μm) 来分离微生物群落.

主要成果:

• 社区组成的变化是由特定的细菌类 (Planctomycetota, Bacteroidota, Verrucomicrobiota, Gammaproteobacteria) 驱动的,这些细菌与大颗粒相关.
• 自由生活和与小颗粒相关的社区显示了Nitrososphaerota,Alphaproteobacteria,Actinomycetota和Nitrospinota的相对丰度较高.
• 网络分析揭示了真菌和 prokaryotes 在粒子关联分数之间的假定相互作用,包括真菌和 SAR11 在小粒子之间的负连接,以及在大粒子中的各种连接.

结论:

• 三级大小分割过对于获得对海洋微生物生态学的新见解是有效的.
• 在OMZ中,微生物相互作用,特别是粒子相关分数内的真菌和核细胞之间的相互作用,在OMZ中很重要.
• 特定的细菌群体主导着不同的粒子大小分数,并受到氧气梯度的影响.