门德尔的随机化确定了参与神经退行性疾病的蛋白质

科学领域:

• 遗传学和基因组学 遗传学和基因组学
• 蛋白质组学是指蛋白质组学.
• 神经科学是一个神经科学.
• 生物化学 生物化学

背景情况:

• 蛋白质在生物功能中起着至关重要的作用,高通量技术使生物银行能够进行大规模的蛋白质分子测量.
• 了解血蛋白与神经退行性疾病之间的联系对于确定新的治疗点和了解疾病机制至关重要.

研究的目的:

• 识别与阿尔茨海默病,帕金森病,多发性硬化症和肌缩性侧面硬化症因果相关的蛋白质.
• 利用大规模的遗传和蛋白质组数据,对人体血蛋白质组在神经退化中的作用进行全面分析.

主要方法:

• 进行了一项双样本的cis 门德尔随机化研究,使用来自英国生物银行和deCODE健康研究的蛋白质组数据 (>2700种蛋白质).
• 蛋白质丰度的仪器变量与四种神经退行性疾病的全基因组关联研究 (GWAS) 数据相结合.
• 沃尔德比率用于估计潜在的因果关系,统计学意义评估使用5%的错误发现率和同定位分析 (后置概率>0.80).

主要成果:

• 在13377个测试的关联中,169个具有统计学意义,在同局部化分析后确定了50个独特的蛋白质疾病关联.
• 其中23个关联涉及遗传位点,GWAS以前与这些疾病没有联系.
• 特定的蛋白质与疾病途径有关,包括补充物 (C1S,C1R),微质 (SIRPA),阿尔茨海默氏症的溶酶体 (CLN5);帕金森症的介质素-6途径 (CTF1);溶酶体 (TPP1) 的ALS;和血脑屏障完整性 (VEGFB) 的MS.

结论:

• 本研究使用两个主要的蛋白质组平台,全面评估了血蛋白质组对神经退行性疾病的影响.
• 新发现的蛋白质关联突出显示了补体,微质细胞,溶解体和血脑屏障完整性在神经退行过程中的参与.
• 利用大规模的基因组和蛋白质组数据,可以对神经退行性疾病的病变产生有强大的洞察力.