通过在侵袭性病变前的病变进展中的分子变化,对I期肺腺癌的分子亚型进行分类
Jun Shang1,2,3,4, He Jiang3, Yue Zhao1,2,4
1Departments of Thoracic Surgery and State Key Laboratory of Genetic Engineering, Fudan University Shanghai Cancer Center, Shanghai, China.
Journal of translational medicine
|March 5, 2025
概括
我们通过分析关键的分子变化,确定了I期肺腺癌 (LUAD) 的两个不同的分子亚型. 这一发现有助于识别高风险的LUAD患者,以提供量身定制的治疗.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 肺腺癌 in situ (AIS) 和微侵袭性腺癌 (MIA) 是可以治愈的,但20%的I阶段LUAD患者的预后不佳.
- 可治愈的AIS/MIA和预后不佳的I期LUAD之间的关键分子差异仍然不清楚.
- 这项研究调查了分子变化,以区分LUAD亚型.
研究的目的:
- 为了揭示I阶段LUAD的分子和预后不同的亚型.
- 为了确定分离早期肺腺癌的分子驱动因素.
- 开发一个模型来识别高风险I期LUAD患者.
主要方法:
- 从197个瘤正常样本 (AIS,MIA,侵入性LUAD) 中分析了RNA和全外体序列数据.
- 利用数字滴滴PCR (ddPCR) 和免疫组织化学 (IHC) 进行基因和蛋白质表达分析.
- 使用大规模RNA-seq数据集 (954个LUAD,包括541个I阶段) 和12个已发表的数据集 (1331个I阶段LUAD) 验证的发现.
主要成果:
- 与AIS/MIA相比,侵入性LUAD中的基因组和转录组水平显著受到焦点粘附 (FA) 途径的干扰.
- COL11A1和THBS2基因显示了从AIS/MIA到I阶段LUAD的调节.
- 在无监督的聚类中,根据COL11A1和THBS2的表达,确定了I阶段LUAD的两种亚型 (S1,S2),S2表现出更多的体质变化,并激活了癌症相关纤维细胞 (CAF).
结论:
- 确定了I阶段LUAD的两个不同的分子和预后亚型 (S1,S2).
- 该FA2模型 (COL11A1,THBS2) 有效地区分了I阶段的LUAD亚型.
- 这种分类有助于识别高风险I阶段的LUAD患者,以加强治疗策略.
