沿海沉积物的间歇性微生物群落主要由Nanoarchaeota主导
Simone Brick1, Jutta Niggemann1, Anja Reckhardt1
1School of Mathematics and Science, Institute for Chemistry and Biology of the Marine Environment (ICBM), Carl von Ossietzky Universität Oldenburg, Oldenburg, Germany.
Frontiers in microbiology
|March 5, 2025
概括
沿海沉积物孔水有独特的微生物群落,与沙子上的微生物不同. 这些自由生活的社区富含着古生物,包括Nanoarchaeota和候选Phyla辐射细菌.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 海洋微生物生态学
- 地质微生物学的生物.
背景情况:
- 地表沿海沉积物是各种微生物群落的宿主,对营养循环至关重要.
- 沙沉积物中的大多数微生物是epipsammon (附着在谷物上),在孔水中只有少数微生物.
- 这些自由生活的间歇性微生物群落的组成在很大程度上是未知的.
研究的目的:
- 为了比较地下沿海沉积物及其相应的孔水中的考古和细菌社区结构.
- 描述间隙孔水中自由生活的微生物群落的独特组成和多样性.
- 调查隔离和描述新型微生物的潜力,如Nanoarchaeota和候选物质辐射 (CPR) 细菌.
主要方法:
- 应用了16S rRNA基因测序来分析微生物社区结构.
- 沉积物和间隙孔水样本中的微生物群落的比较.
- 考古和细菌社区组成,多样性和丰富性的分析.
主要成果:
- 自由生活的原核生物构成了微生物群落总数中很小的一小部分 (0.22.3%).
- 间歇性微生物群落与沉积物附着微生物的重叠 (47% ASVs) 是很小的.
- 7581%的ASVs的独特成分仅在孔水中发现,具有更高的多样性和古生物与细菌的比率.
- 考古物被纳米考古物 (DPANN超级族) 主导,细菌包括CPR成员.
- 在相邻的潮平面生态系统中也观察到类似的趋势.
结论:
- 在地下沿海沉积物中存在明显的间歇性微生物群落.
- 这些社区富含尚未培养的Nanoarchaeota和CPR细菌.
- 这些发现为有针对性的元基因组分析和新型微生物的隔离提供了机会,以进行代谢表征.
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