使用各种机器学习算法,对糖尿病视网膜病变中与内细胞网膜应激相关的基因进行研究和验证
Limin Zheng1, Yaodan Cao2, Jinqi Hao3
1Department of Ophthalmology, Jiangsu Province Hospital, The First Affiliated Hospital of Nanjing Medical University, Nanjing Medical University, No. 368, Jiangdong North Road, Gulou District, Nanjing 210000, Jiangsu Province, China; Department of Ophthalmology, The First Affiliated Hospital of Baotou Medical College, Inner Mongolia University of Science and Technology, Baotou, Inner Mongolia Autonomous Region, China.
Experimental eye research
|March 5, 2025
概括
两个关键基因,SELENOS和HSPA5,显示为糖尿病视网膜病变 (DR) 的早期诊断生物标志物具有前途. 这些与内质网膜压力相关的基因可能会导致个性化的DR治疗和改善患者的治疗结果.
科学领域:
- 眼科医生 眼科 眼科
- 遗传学 是一个遗传学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 糖尿病视网膜病变 (DR) 是糖尿病的一个重要并发症.
- 细胞内膜网膜应激 (ERS) 与DR病原发生有关,影响细胞反应.
- 识别早期诊断标志物对于个性化DR治疗策略至关重要.
研究的目的:
- 为了确定糖尿病视网膜病变 (DR) 的早期诊断生物标志物.
- 为了研究内细胞网膜压力 (ERS) 相关基因在DR中的作用.
- 探索个性化DR治疗的潜在目标.
主要方法:
- 收集了DR和健康对照 (HC) 的基因表达综合 (GEO) 数据库样本.
- 识别了差异表达的ERS相关基因 (DE-ERSRGs),并使用机器学习确定特征DE-ERSRGs (FDE-ERSRGs).
- 通过ROC曲线分析评估诊断准确性,并进行差异表达,共同表达,功能,通路和免疫细胞透分析.
主要成果:
- 确定了55个DE-ERSRG,突出了SELENOS和HSPA5作为具有高诊断潜力的关键FDE-ERSRG (AUC为0.792和0.799).
- 检查了DR中的差异性/协同表达模式,分子功能,生物途径和免疫细胞透.
- 在DR和HC组之间发现了免疫细胞透的显著差异,与FDE-ERSRGs相关.
结论:
- 提供了对DR分子机制和代谢途径的新见解.
- 突出显示了SELENOS和HSPA5作为DR的有前途的诊断生物标志物.
- 建议用于识别DR管理的新型诊断和免疫治疗生物标志物的潜力.
