开发一种基于MassARRAY的高通量单一试验,用于描述Streptococcus suis物种和血清型
Surasak Jiemsup1, Kamonwan Lunha2, Wiyada Chumpol2
1National Center for Genetic Engineering and Biotechnology (BIOTEC), National Science and Technology Development Agency (NSTDA), Phahonyothin Road, Khlong Luang, Pathum Thani, 12120, Thailand. surasak@biotec.or.th.
Scientific reports
|March 6, 2025
概括
一种新的MassARRAY测定方法可以准确识别Streptococcus suis和所有29种血清型. 这种快速方法有助于对这种重要的猪病原体和动物传染病原体的监测和控制.
科学领域:
- 兽医微生物学 兽医微生物学
- 分子诊断学 分子诊断
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 在全球范围内,Streptococcus suis是猪和人类疾病的主要原因.
- 准确识别和血清定型S. suis对于疾病监测和控制至关重要.
- 目前的方法可能耗时,或缺乏对所有血清型的全面覆盖.
研究的目的:
- 开发一种新的,基于MassARRAY的单一测定方法,用于同时识别和区分所有29种血清型的S. suis物种.
- 提供一个快速,准确和高效的诊断工具,用于S. suis监测.
主要方法:
- 针对性放大谷氨酸脱酶 (gdh) 和重组/修复蛋白 (recN) 基因,用于物种识别.
- 囊多糖体 (cps) 基因的有针对性的放大和单核酸多形态 (SNP) 的分析,用于血型定型.
- 使用来自105个全基因组测序 (WGS) 确认的分离物和143个现场分离物的基因组DNA进行验证.
主要成果:
- 在WGS验证的隔离物中,MassARRAY测定实现了100%的特异性和灵敏性,用于物种识别和血清型定型.
- 使用现场分离的评估结果显示,WGS与物种识别完全一致 (100%的灵敏度/特异性),与血型识别高度一致 (99.15%的灵敏度,100%的特异性, κ=0.98).
- 该试验显示了低检测极限 (1-10 pg gDNA),并根据SNP准确区分了特定的血清型对.
结论:
- 开发的MassARRAY测定是一种高度特定和敏感的工具,用于同时识别S. suis物种和血清型.
- 这种新型检测为S. suis.的常规诊断,监测和疫情调查提供了宝贵的进步.
- 测试的效率和准确性有助于在动物和人类健康方面改善S. suis感染的管理.
