通过 Motif-SELEX 提高 Aptamer 亲和度和确定序列活动关系

科学领域:

• 生物技术
• 分子生物学
• 核酸化学

背景情况:

• 通过指数式丰富对联体的系统进化 (SELEX) 是由于对序列空间的不完整选而受到限制,往往导致表现不佳的合体.
• 传统的后SELEX优化方法,如化SELEX和易发生错误的PCR引入了偏差和局限性,阻碍了优异的胺序列的发现.

研究的目的:

• 通过产生多种序列和长度变化来优化核酸体的新方法Motif-SELEX.
• 克服传统方法的局限性,以改善胺基亲和度,并发现新的结合序列.

主要方法:

• 开发了Motif-SELEX以创建代表父体的广泛序列和长度变化的库.
• 将Motif-SELEX应用于基于DNA的吗啡和基于RNA的阿皮克萨班合剂以进行优化.
• 分析了Motif-SELEX池,以确定关键的序列和结构元素.

主要成果:

• 发现了与原始序列相比增强了多达10倍的新型胺序列.
• 通过传统方法无法获得的优化随机域长度的识别序列.
• 成功预测二级和三级结构,包括具有非正规核酸相互作用的结构.

结论:

• Motif-SELEX是一种优化核酸胺结构和结合亲和力的有效和可通用方法.
• 该方法可以发现高亲和度的体,并提供结构功能关系的见解.
• Motif-SELEX为需要高性能核酸分子的各种应用提供了强大的工具.