对17q21.31的拷贝数变化和哈普类型分析揭示了与神经细胞进步超核麻和基因表达变化相关的风险增加
Hui Wang1,2, Timothy S Chang3, Beth A Dombroski1,2
1Department of Pathology and Laboratory Medicine, Perelman School of Medicine, University of Pennsylvania, Philadelphia, Pennsylvania, USA.
概括
在17q21.31的玛 (γ) 拷贝数变异 (CNV) 的拷贝数与逐渐超核性麻 (PSP) 风险的增加有关. 具有额外 γ 副本的特定结构形式增加了PSP的易感性,影响了基因表达.
科学领域:
- 遗传学 是一个遗传学.
- 神经科学是一个神经科学.
- 基因组结构的变化
背景情况:
- 17q21.31区域以H1/H2单元型和副本数变异 (CNVs) 为特征,是渐进性上核性麻 (PSP) 最强的遗传风险位.
- 了解这些结构变异的作用对于阐明PSP病原性至关重要.
研究的目的:
- 调查17q21.31区域内特定的CNV和结构形式之间的关联以及开发PSP的风险.
- 分析这些遗传变异如何影响基因表达,并可能导致PSP.
主要方法:
- 分析了来自1684例PSP病例和2392例对照组的全基因组测序数据.
- 在17q21.31确定了三种大型CNV (α,β和γ) 和结构形式,并评估了它们与PSP风险的关联.
- 基因表达的变化,包括特定基因的上调和下调,用RNA测序分析了对gα重复的反应.
主要成果:
- 玛 (γ) CNV的复制数增加与更高的PSP风险显著相关 (OR=1.10,P=0.0018).
- 具有额外γ副本的特定H1结构形式 (例如H1β1γ4) 显示PSP风险明显增加 (OR=1.57).
- γ重复导致了几个基因的改变表达,包括ARL17B,LRRC37A/LRRC37A2和NSFP1,而LRRC37A/LRRC37A2主要影响的神经元细胞.
结论:
- 在17q21.31的γ拷贝数独立地与PSP风险相关,即使考虑到H1/H2单元型.
- 17q21.31区域的复杂结构组织是评估PSP遗传易感性的关键因素.
- 这些发现凸显了考虑CNV和PSP遗传结构中的结构变异的重要性.
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